労働条件を定める方法としては、就業規則の他に、「労働契約」や、労働基準法等の労働諸法令、さらに、労働組合のある事業場では「労慟協約」（労働組合と使用者の間で結ばれる労働条件その他に関する協定（労組法14））がある。
それぞれの効力の序列を、大きい基準から示すと次のようになる。
⑴ 法令
法令の基準に達しない労働条件は、その基準による。
⑵ 労働協約
労働協約の定めに反することはできない。
⑶ 就業規則
就業規則の水準に達しない労働条件は、その水準となる。
⑷ 労働契約
労働基準法１３条では、次のように規定しています。
「 この法律で定める基準に達しない労働条件を定める労働契約は、その部分については無効とする。
この場合において、無効となった部分は、この法律で定める基準による。」
労働契約書に書いてあっても、それ以上に強い規定が存在するんですね。よくよく会社の規定は見ないといけません。